Le secteur agricole moldave emploie la majorité de la population et contribue à hauteur du quart du PIB national. Les exportations du domaine agro-alimentaire comptent pour plus du tiers des exportations totales du pays. Le pays compte peu de spécialisations industrielles, et celles-ci concernent généralement des secteurs à faible valeur ajoutée, du fait de l'insuffisance de l'investissement privé.

Le secteur industriel de la Moldavie, représenté par l'industrie mécanique, l’industrie des matériaux de construction et l’industrie agroalimentaire, s'est effondré à la suite de l'implosion de l'URSS. Seules quelques centaines d'entreprises sont encore actives, mais toutes sont confrontées à des difficultés plus ou moins sérieuses. Une partie importante d'entre elles sont situées en Transnistrie. Le secteur de l'énergie est privatisé.

L'industrie légère est plus diversifiée et plus productive, grâce notamment aux investissements étrangers. Se distinguent les activités textiles et la production de bois et de meubles.

Le secteur bancaire et financier constitue une des rares satisfactions des réformes économiques. La Moldavie dispose d'une banque centrale indépendante et de banques commerciales, principalement détenues par des capitaux étrangers. Le pays a également mis en place un marché des obligations publiques et d'un marché des changes. D'un point de vue normatif, les résultats atteints par le système financier moldave ont été salués par le FMI, mais il reste à confirmer ces progrès en pratique.

Pour des raisons de compétence de main-d'oeuvre, mais également du fait de la "discrétion" de telles activités, le secteur informatique moldave est relativement performant.