Les grandes villes et les parcs nationaux attirent l'essentiel des touristes en Estonie. Les autres atouts touristiques du pays sont le tourisme historique et culturel, le tourisme de nature (pêche, chasse, écotourisme...) et parcs nationaux et les centres de remise en forme. Les villes de Pärnu, la capitale de l’été, et de Tallin proposent une diversité de soins dans leurs centres thermaux et de remise en forme, orientés vers la relaxation et le bien-être.

Capitale de l’Estonie, Tallin constitue traditionnellement la principale attraction du tourisme dans le pays. Tartu est également riche d'un point de vue historique et culturel. Malgré les nombreuses bases et constructions militaires de l’époque soviétique qui défigurent le paysage, les îles d'Estonie, comme Hiiumaa et Saaremaa, conservent les traits authentiques de la vie rurale traditionnelle. La vie y est beaucoup plus sûre que sur le continent et la nature y est préservée.